Vilniaus universitetas yra jėzuitiškos tradicijos universitetas ir iki šiol bendradarbiauja su tėvais jėzuitais, kurie puoselėja dvasingumo cura personalis (asmeninis rūpestis kiekvienu žmogumi).
VU kapelionas ir pagalbininkai teikia dvasines konsultacijas ir paramą. Į VU kapelioną galima kreiptis dėl Krikšto, Pirmosios Komunijos, Santuokos ar Sutvirtinimo sakramentų. Taip pat – netekties atveju.
Šv. Jonų bažnyčioje įkurta kun. Alfonso Lipniūno koplyčia. Joje įrengtas kapeliono kabinetas ir sielovadinė stotelė – erdvė universiteto bendruomenei, skirta universiteto studentams, dėstytojams, darbuotojams. Taip pat dvasinė parama teikiama ir Fizikos fakultete (Saulėtekio al. 9 Vilniuje) įsikūrusiame psichologinio konsultavimo kabinete.
VU kapelionas kviečia į pamaldas, maldos grupes, susikaupimo vakarus, koncertus.